Η Ιωάννα Παγώνη είναι Επίκουρη Καθηγήτρια στο Τμήμα Οικονομικής και Διοίκησης Τουρισμού, της Σχολής Επιστημών της Διοίκησης του Πανεπιστημίου Αιγαίου, με γνωστικό αντικείμενο «Τουριστικές Μεταφορές και Περιβάλλον» (ΦΕΚ Διορισμού: 2522/29.09.2023 τ. Γ’). Έλαβε το διδακτορικό δίπλωμα της από το Τμήμα Πολιτικών Μηχανικών του Εθνικού Μετσόβιου Πολυτεχνείου (2017), ενώ κατέχει μεταπτυχιακό δίπλωμα ειδίκευσης (M.Sc.) στα «Μαθηματικά της Αγοράς και της παραγωγής» από το Οικονομικό Πανεπιστήμιο Αθηνών και το Εθνικό και Καποδιστριακό Πανεπιστήμιο Αθηνών (2013), καθώς και Δίπλωμα Πολιτικού Μηχανικού από το Εθνικό Μετσόβιο Πολυτεχνείο (2009).
Έχει συνεργαστεί με πλήθος ιδιωτικών φορέων ως σύμβουλος στην διεξαγωγή συγκοινωνιακών ερευνών, ενώ συμμετέχει ως ερευνήτρια σε Ευρωπαϊκά και εθνικά ερευνητικά έργα σε θέματα μεταφορών και καινοτόμων υπηρεσιών κινητικότητας. Έχει διδάξει επί σειρά ετών σε προπτυχιακά και μεταπτυχιακά προγράμματα σπουδών σε ελληνικά πανεπιστήμια, ενώ έχει πραγματοποιήσει προσκεκλημένες διαλέξεις σε πανεπιστήμια της αλλοδαπής. Έχει δημοσιεύσει πάνω από 80 άρθρα σε επιστημονικά περιοδικά και συνέδρια, ενώ έχει συμμετάσχει στη συγγραφή εκθέσεων διεθνών οργανισμών. Είναι κριτής σε διεθνή περιοδικά και μέλος Επιστημονικών και Οργανωτικών Επιτροπών σε διεθνή συνέδρια.